La fregata magnifica è lunga un metro, con un'apertura alare di 2,15 m, è interamente nera fatta eccezione per il collo di colore rosso nei maschi e bianco nelle femmine; nel maschio ospita una tasca che viene gonfiata durante la stagione dell'accoppiamento per richiamare l'attenzione delle femmine e allo stesso tempo per far risuonare il suo richiamo, dal suono simile a un sonaglio